Hoe werkt Sanger DNA-sequencing?
Hoe werkt Sanger DNA-sequencing?

Video: Hoe werkt Sanger DNA-sequencing?

Video: Hoe werkt Sanger DNA-sequencing?
Video: Sanger sequencing 2024, November
Anonim

Sanger-sequencing resulteert in de vorming van verlengingsproducten van verschillende lengtes die eindigen met dideoxynucleotiden aan het 3'-uiteinde. De extensieproducten worden vervolgens gescheiden door capillaire elektroforese of CE. De moleculen worden door een elektrische stroom geïnjecteerd in een lange glazen capillair gevuld met een gelpolymeer.

Op deze manier, wat is de Sanger-methode voor DNA-sequencing?

Sanger-sequencing , ook bekend als de kettingafsluiting methode , is een techniek voor DNA sequentie gebaseerd op de selectieve opname van ketenbeëindigende dideoxynucleotiden (ddNTP's) door DNA polymerase tijdens in vitro DNA replicatie. Het is ontwikkeld door Frederick Sanger en collega's in 1977.

En hoe werkt chain-termination-sequencing? Sanger-DNA volgorde aanbrengen in is ook bekend als de ketting - beëindiging methode van volgorde aanbrengen in . ddNTP's resulteren in beëindiging van de DNA-streng omdat ddNTP's de 3'-OH-groep missen die nodig is voor de vorming van fosfodiesterbindingen tussen nucleotiden. Zonder deze band, de ketting van nucleotiden die worden gevormd is beëindigd.

Simpel gezegd, waarom doen we Sanger-sequencing?

Sanger-sequencing is: een methode van DNA sequentie gebaseerd op de selectieve inbouw van ketenbeëindigende dideoxynucleotiden door DNA polymerase tijdens in vitro DNA replicatie. Het heeft nog steeds het voordeel ten opzichte van short-read volgorde aanbrengen in technologieën (zoals Illumina) die het kan produceren DNA-sequentie: leest van > 500 nucleotiden.

Is de Sanger-sequencing nauwkeurig?

Sanger-sequencing met 99,99% nauwkeurigheid is de “gouden standaard” voor klinisch onderzoek volgorde aanbrengen in . Nieuwere NGS-technologieën worden echter ook gebruikelijk in klinische onderzoekslaboratoria vanwege hun hogere doorvoercapaciteit en lagere kosten per monster.

Aanbevolen: